Цитата: У нас - ООО
Простите, я почему-то принял Вас за ИП (главу КФХ) ... 😀
Увы, стереотипы одолевают!
Цитата: Я сформировала Уведомление в программе "Налогоплательщик ЮЛ" и отправила через ЭДО письмом с вложением Уведомления в формате xml. Состояние письма - "Доставлено в ФНС", есть "Извещение о получении".
Вот, значит, я в правильном направлении Вас посылал!
Если есть извещение о получении Вашего уведомления, значит, всё в порядке.
Сделайте и сохраните "скрин" с экрана с этим извещением. Желательно, чтобы текущая дата где-нибудь была видна и адрес сайта...
Цитата: Думаю, нужно подтвердить прием Уведомления звонком в ИФНС...
Чисто теоретически необходимости в этом нет.
Но если это не сопряжено с нечеловеческими усилиями, то лучше, конечно, продублировать звонком.
Успехов!